No centro do escândalo desvendado pela Operação Carne Fraca, o Ministério da Agricultura é comandado pelo PMDB e pelo PP há 18 anos. Segundo a Coluna Estadão, do jornal O Estado de S. Paulo, desde 1999 os dois partidos indicaram 10 dos 11 ministros nomeados por FHC, Lula e Dilma. De 2007 para cá, seis eram filiados ao PMDB.
A dobradinha foi retomada quando Michel Temer assumiu o poder e nomeou Blairo Maggi, que saiu do PR e foi para o PP com o intuito de assumir a Agricultura. Segundo os investigadores da Polícia Federal, PP e PMDB receberam propina do esquema que vendia carne podre.